NEO
トーマス・アンダーソン / ネオ
昼はプログラマー、夜はハッカーとして生きる男。現実世界への違和感から真実を追い求める中、モーフィアスと出会い、マトリックスから解放される。人類を救う“救世主”であると予言されているが、本人はその運命を受け入れられずにいる。

トーマス・アンダーソン / ネオ
昼はプログラマー、夜はハッカーとして生きる男。現実世界への違和感から真実を追い求める中、モーフィアスと出会い、マトリックスから解放される。人類を救う“救世主”であると予言されているが、本人はその運命を受け入れられずにいる。
トリニティー
モーフィアスが率いるゲリラチームの優秀な戦士であり、凄腕のハッカー。ネオをマトリックスから解放する重要な役割を担う。冷静沈着だが、ネオに対しては特別な感情を抱いている。オラクル(預言者)から、自分が愛する男が救世主になるという予言を受けている。
モーフィアス
飛行船ネブカドネザル号の船長であり、機械の支配に抵抗する人類のリーダー。救世主の出現を固く信じ、その人物がネオであると確信している。ネオの師として、彼を導き、マトリックスの真実と戦い方を教える。
エージェント・スミス
マトリックスを監視・支配するエージェント・プログラムのリーダー格。物理法則を無視した超人的な能力を持つ。人類を「ウイルス」と見なし、マトリックスから解放された人間たちを執拗に追い詰める。ネオに対して異常なまでの敵意を燃やす。
オラクル(預言者)
マトリックス内に存在する、未来を予知する能力を持つとされる謎のプログラム。抵抗軍のメンバーに助言を与えるが、その言葉は常に謎めいている。ネオの運命を知る重要な鍵を握る人物。
サイファー
モーフィアスのチームの一員。9年間、厳しい現実世界で戦い続けた結果、マトリックスの偽りの幸福を懐かしむようになる。真実の重みに耐えきれず、仲間を裏切り、エージェントと取引をしようと企む。